事件突然暴發，猝不及防，那些在場的委員會、監察部、留守部隊的員，也是丈二尺的和尚，不著頭腦，弄不清楚究竟發生了什麽事。

部長張九思突然清醒過來，在皇宮裏厲聲疾呼，高喊其中有詐。留守軍隊司令博敦，看見事突變，當機立斷，手握大錘，立即衝上前去，猝不及防，把騎在馬背上的人打下馬來，命令手下士兵箭齊下，就像飛蝗一般，暴雨一樣傾瀉過去，那些叛軍隊士兵，爭相逃命，立即潰散，很多人不及逃命，當場束手就擒。高和尚等人見事不妙，立即逃竄，不知去向，王著也是一條好漢，麵對強敵，毫不畏懼，麵不改，而出，請求逮捕，接關押。

副總理也先帖木兒知道消息後，立即騎馬跑到元世祖那裏，把突發事變的經過報告了皇帝，當時那裏的駐軍司令察罕腦兒，聽了以，兩眼回圓睜，頭發倒立，非常震怒，立即率領軍隊，急如星火，當就趕到了上都。先帖木兒命令監察委員孛羅、司徒和禮霍孫、委員阿裏等人，立即向各地發布通告，要求各地派出軍隊，到大都續集，合力平定叛。

庚辰那，他們在高梁河捕獲了高和尚。辛巳那，孛羅等人到達了大都。壬午那，他們在刑場上，誅殺了叛發起人王著、高和尚，用刀把他們無地砍了醬，並殺害了張易。

王著在刑場上，知道自己消滅阿合馬的目的已經達到，心裏非常痛快，臨刑時他大聲高呼：“我王著見義勇為，為下除害，今死了，毫不後悔，以後必定有人記錄這一重大曆史事件，讓我青史留名，流芳百世，永垂不朽，我死得其所，死而無憾！”

阿合馬死後，元世祖也還一直蒙在鼓裏，並不完全知道他的謀詭計，詐之，他命令監察部員責問阿合馬的妻子，了解到了許多況。

等到皇帝詳細地詢問到孛羅的時候，才完全知道了阿合馬所犯下的所有滔罪行，那時他才真相大白，如夢初醒，皇帝不大怒起來，高聲道：“王著殺阿合馬，殺得好，為民除害，我舉雙手讚！”

元世祖忽必烈為了發泄心中的怨氣，下令挖開阿合馬的墳墓，砍開棺材，把阿合馬碎萬段，無拋棄在通玄門外，讓群的野狗盡地吃完他的。那些飽欺的員和老百姓，看見碎了阿合馬集團，無不拍手稱快，奔走相告，敲鑼打鼓地熱烈慶賀。

阿合馬集團被消滅後，朝廷斬草除，他的兒子侄子也被全部逮捕殺害，他的家產也被全部沒收沒。阿合馬的的老婆，有一個名引住的，為了活命，藏得很，躲藏在二個被煮的人皮櫃子中，兩隻耳朵都還存在，一個被閹割的太監掌管著櫃子上的鑰匙，打櫃子，把拖了出來，對進行嚴格審訊，也不知道是誰，早已嚇得昏了過去，失去了理智。

也許也是阿合馬榨取的民脂民膏太多，吃得太多，所以他迸濺出來，加倍予以償還，真是罪大惡極，罪有應得。那些叛黨又趁機殺死了中央高中書令郝鎮，拘捕了右丞張惠。頓時宮廷中大鬧起來，作一團，毫無秩序。

叛已經平定後，元世祖就返回燕京都城，還認為阿合馬等人是被冤枉殺死的，準備加以恤，真是是非顛倒，黑白混淆。樞副使孛羅，史書上也記載為博羅。他而出，竭力反對恤阿合馬的家人，還曆數阿合馬的罪狀，憤怒地大聲：“他真是該殺！完全該殺！他罪大惡極，死有餘辜。隻是難為了王著，他為民除害，死得冤枉。”

忽辛當時是江淮右丞，被逮捕以後，皇帝命令朝廷的大臣對他進行審訊，忽辛反駁他們：“你們曾經接過我家的錢財，怎麽有資格審問我所犯下的罪過？”後來到參知政事張雄飛審問忽辛的時候，他先詢問忽辛：“我也曾經接你們家的錢財沒有？”

忽辛回答沒有，張雄飛接著對他：“你如此來，我就有資格審問你了？”就審問清楚了忽辛的罪過，依法將他死。元世祖後來雙聽郝鎮黨羽的罪惡，也下令對他進行屠殺的懲罰。

另外還有右丞耿仁，與郝鎮一樣犯有同樣的罪過，把他關進監獄，判了死刑。其餘的犯罪分子，也一律罷免，予以嚴懲，並裁減了多餘的員七百一十四人，撤銷了府機構二百多所，通過這次大清洗，朝廷外總算整頓好了。